Σύμφωνα με την Υπουργική Απόφαση αριθμ. ΔΤΔ Α 1080981 ΕΞ2016 (ΦΕΚ Β’ 1542/31-05-2016) τροποποιείται η αριθμ. ΔΤΔ Α 1060878 ΕΞ2016 (ΦΕΚ 1223 Β/27-4-2016) για τη διεκπεραίωση τελωνειακών διατυπώσεων. και το ωράριο λειτουργίας των κάτωθι τελωνείων ορίζεται ως εξής:

Το τελωνείο Ε’ Πειραιά λειτουργεί με νέο ωράριο από Δευτέρα έως και Παρασκευή 7:30 - 19:00 για τη διεκπεραίωση τελωνειακών διαδικασιών και διατυπώσεων και έως τις 21:00 για τις διατυπώσεις εξόδου των εμπορευμάτων. Σάββατο το τελωνείο λειτουργεί 7:30 - 13:00 για τη διεκπεραίωση τελωνειακών διαδικασιών και διατυπώσεων. Κυριακή το τελωνείο λειτουργεί κατόπιν σχετικής αίτησης, με δαπάνες και έξοδα του αιτούντος.

Το Τελωνείο ΣΤ΄ Πειραιά λειτουργεί με νέο ωράριο για τη διεκπεραίωση τελωνειακών διαδικασιών και διατυπώσεων, από Δευτέρα έως Παρασκευή 7:30 - 19:00. Ειδικότερα, την Παρασκευή το Τελωνείο λειτουργεί για διατυπώσεις εξαγωγής έως τις 21:00. Σάββατο και Κυριακή το τελωνείο λειτουργεί κατόπιν σχετικής αίτησης, με δαπάνες και έξοδα του αιτούντος.

Τέλος, τα τελωνεία δύνανται να λειτουργούν και πέραν των ανωτέρω καθοριζόμενων ωρών και ημερών κατόπιν σχετικής αίτησης των ενδιαφερομένων σύμφωνα με την ισχύουσα νομοθεσία.